1、地域限制。公积金借款通常是只能在公积金缴纳地借款的，现在许多都不能实现跨区域借款买房，这样许多人在北上广深打拼的，只能选择高房价买房，而不能回到老家去用公积金借款买房价低的房子。
2、住房类型限制。申请公积金贷款，房屋类型也有限。只能购买商品房、存量房、房改房、自建房、搬迁房、无产权房等住房类型，只能购买支持基本住房需求。
3、放款速度慢。用公积金贷款买房的程序比纯商业贷款本身更复杂。签订合同后，还需要办理抵押登记等手续。受托商业银行严格控制抵押规模的，贷款发放时间不少于三个月。
公积金贷款的优势
1、低利率是公积金贷款最大优势
公积金贷款最大的优势即低利率，这一优势在7月7日年内第三次加息后更加明显。目前，公积金贷款首套房要比商业贷款低2.15个百分点，二套房要比商业贷款低2.37个百分点，以80万、20年期贷款计算，公积金贷款首套、二套房要比商业贷款每月少还月供千元上下，节省总利息超20万元。
2、贷款政策优惠更迎合购房人需求
贷款政策多变，在首套房贷款上，公积金贷款执行90平米以下首付20%、90平米以上首付30%的贷款政策;在二套房贷款上，虽然商业贷款和公积金贷款同为首付60%、利率上浮1.1倍，但公积金贷款一方面有着低利率优势，另一方面，公积金“认房不认贷”的认定标准更为人性化，不但与限购判定标准统一，而且符合实际市场情况。公积金贷款首套、二套房的优惠政策也在很大程度上获得了借款人更多青睐。
3、批贷放款不受限制速度媲美商贷
近年以来商业贷款放贷额度一直吃紧，进入下半年这种现象仍未得到缓解，各家银行客户排队等候放款的情况比比皆是，而公积金贷款则丝毫未受放贷额度限制，目前在放款速度上可以与商贷媲美，甚至个别区的公积金贷款周期已经超过了商业贷款。
职工住房公积金是我国推行住房制度改革的一项措施，目的在于由国家、集体、个人三方共同负担，解决职工住房困难。凡是缴存公积金的职工均有享受此种贷款的权利，均可按公积金贷款的相关规定，申请公积金贷款。
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