小产权房子不能直接办理房产证，只有通过过户才可以取得房产证。
具体办理房产证的流程如下：
1、小产权房屋开发人根据建房批复，城填规划许可证到土管局缴纳一定量的土地出让金，变集体土地为国有土地。
2、小产权的建筑商到地税部门交纳4.38%的建筑环节税收。
3、根据变更的国有土地使用证和交纳的建筑环税收票证、建房批复、城镇规划许可证到房管部门办理房屋总证。
4、房屋购买者凭房屋总证，房屋产权过户表，买卖双方身份证复印件，购买房屋合同到财政部门(农村财政税收和农村财务管理局)交纳契税。
5、到地税部门交纳房屋销售环节的各项税收。
6、凭以上各种手续和交纳的税收票据或税收减免证到房屋管理部门办理房产权过户手续。
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